Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD9O00233 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD9O00233 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD9O00233 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD9O00233 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMD9O00233 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD9O00233 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD9O00233 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD9O00233 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD9O00233 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD9O00233 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD9O00233 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD9O00233 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD9O00233 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD9O00233 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD9O00233 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD9O00233 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD9O00233 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD9O00233 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD9O00233 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD9O00233 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD9O00233 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD9O00233 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD9O00233 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD9O00233 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD9O00233 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD9O00233 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD9O00233 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD9O00233 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD9O00233 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD9O00233 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD9O00233 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD9O00233 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD9O00233 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD9O00233 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD9O00233 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD9O00233 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD9O00233 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD9O00233 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD9O00233 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD9O00233 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD9O00233 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMD9O00233 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms