Protein–RNA interactions for Protein: O00178

GTPBP1, GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1O00178 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTPBP1O00178 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTPBP1O00178 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTPBP1O00178 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTPBP1O00178 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTPBP1O00178 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTPBP1O00178 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP1O00178 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP1O00178 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP1O00178 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTPBP1O00178 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP1O00178 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP1O00178 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTPBP1O00178 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTPBP1O00178 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTPBP1O00178 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTPBP1O00178 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTPBP1O00178 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTPBP1O00178 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTPBP1O00178 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTPBP1O00178 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTPBP1O00178 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTPBP1O00178 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTPBP1O00178 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTPBP1O00178 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTPBP1O00178 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTPBP1O00178 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTPBP1O00178 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTPBP1O00178 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTPBP1O00178 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTPBP1O00178 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GTPBP1O00178 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GTPBP1O00178 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTPBP1O00178 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP1O00178 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTPBP1O00178 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTPBP1O00178 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTPBP1O00178 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTPBP1O00178 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP1O00178 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTPBP1O00178 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTPBP1O00178 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP1O00178 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP1O00178 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP1O00178 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP1O00178 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTPBP1O00178 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTPBP1O00178 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP1O00178 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP1O00178 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTPBP1O00178 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP1O00178 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP1O00178 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
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