Protein–RNA interactions for Protein: K7EN88

hCG_2039718, HCG2039718, isoform CRA_g, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
hCG_2039718K7EN88 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
hCG_2039718K7EN88 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
hCG_2039718K7EN88 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
hCG_2039718K7EN88 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
hCG_2039718K7EN88 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
hCG_2039718K7EN88 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
hCG_2039718K7EN88 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
hCG_2039718K7EN88 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
hCG_2039718K7EN88 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
hCG_2039718K7EN88 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
hCG_2039718K7EN88 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
hCG_2039718K7EN88 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
hCG_2039718K7EN88 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
hCG_2039718K7EN88 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
hCG_2039718K7EN88 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
hCG_2039718K7EN88 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
hCG_2039718K7EN88 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
hCG_2039718K7EN88 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
hCG_2039718K7EN88 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
hCG_2039718K7EN88 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_2039718K7EN88 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_2039718K7EN88 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
hCG_2039718K7EN88 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
hCG_2039718K7EN88 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
hCG_2039718K7EN88 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
hCG_2039718K7EN88 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
hCG_2039718K7EN88 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
hCG_2039718K7EN88 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
hCG_2039718K7EN88 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
hCG_2039718K7EN88 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
hCG_2039718K7EN88 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
hCG_2039718K7EN88 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
hCG_2039718K7EN88 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
hCG_2039718K7EN88 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
hCG_2039718K7EN88 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
hCG_2039718K7EN88 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
hCG_2039718K7EN88 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
hCG_2039718K7EN88 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
hCG_2039718K7EN88 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
hCG_2039718K7EN88 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
hCG_2039718K7EN88 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
hCG_2039718K7EN88 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
hCG_2039718K7EN88 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
hCG_2039718K7EN88 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
hCG_2039718K7EN88 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
hCG_2039718K7EN88 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25■■□□□ 1.59
hCG_2039718K7EN88 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
hCG_2039718K7EN88 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
hCG_2039718K7EN88 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
hCG_2039718K7EN88 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
hCG_2039718K7EN88 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
hCG_2039718K7EN88 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
hCG_2039718K7EN88 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
hCG_2039718K7EN88 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
hCG_2039718K7EN88 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
hCG_2039718K7EN88 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
hCG_2039718K7EN88 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
hCG_2039718K7EN88 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
hCG_2039718K7EN88 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
hCG_2039718K7EN88 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
hCG_2039718K7EN88 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
hCG_2039718K7EN88 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
hCG_2039718K7EN88 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
hCG_2039718K7EN88 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
hCG_2039718K7EN88 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
hCG_2039718K7EN88 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
hCG_2039718K7EN88 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms