Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMX2-CTNND1H3BSU7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMX2-CTNND1H3BSU7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMX2-CTNND1H3BSU7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMX2-CTNND1H3BSU7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMX2-CTNND1H3BSU7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX2-CTNND1H3BSU7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX2-CTNND1H3BSU7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX2-CTNND1H3BSU7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX2-CTNND1H3BSU7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms