Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DIRC3C9JPN6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DIRC3C9JPN6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
DIRC3C9JPN6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DIRC3C9JPN6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DIRC3C9JPN6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DIRC3C9JPN6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DIRC3C9JPN6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DIRC3C9JPN6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DIRC3C9JPN6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DIRC3C9JPN6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DIRC3C9JPN6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DIRC3C9JPN6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DIRC3C9JPN6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DIRC3C9JPN6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DIRC3C9JPN6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DIRC3C9JPN6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DIRC3C9JPN6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DIRC3C9JPN6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DIRC3C9JPN6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DIRC3C9JPN6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DIRC3C9JPN6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DIRC3C9JPN6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DIRC3C9JPN6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DIRC3C9JPN6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
DIRC3C9JPN6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DIRC3C9JPN6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms