Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN25C9JDP6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN25C9JDP6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN25C9JDP6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN25C9JDP6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN25C9JDP6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN25C9JDP6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN25C9JDP6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN25C9JDP6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN25C9JDP6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN25C9JDP6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN25C9JDP6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN25C9JDP6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN25C9JDP6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN25C9JDP6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN25C9JDP6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN25C9JDP6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN25C9JDP6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN25C9JDP6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms