Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
B4E171 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
B4E171 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
B4E171 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
B4E171 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E171 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E171 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E171 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E171 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E171 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
B4E171 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
B4E171 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
B4E171 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E171 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
B4E171 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
B4E171 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
B4E171 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
B4E171 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E171 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E171 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E171 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E171 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
B4E171 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4E171 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4E171 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4E171 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4E171 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E171 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E171 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E171 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4E171 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E171 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4E171 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4E171 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4E171 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4E171 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4E171 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4E171 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4E171 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4E171 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4E171 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
B4E171 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4E171 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4E171 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4E171 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4E171 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4E171 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E171 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E171 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4E171 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E171 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E171 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E171 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4E171 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4E171 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
B4E171 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E171 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E171 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
B4E171 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
B4E171 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E171 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E171 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E171 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E171 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E171 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4E171 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4E171 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E171 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E171 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E171 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E171 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E171 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E171 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E171 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E171 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E171 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E171 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E171 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E171 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E171 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E171 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E171 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E171 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E171 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E171 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
B4E171 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
B4E171 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
B4E171 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
B4E171 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E171 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E171 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
B4E171 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
B4E171 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
B4E171 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
B4E171 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
B4E171 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
B4E171 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
B4E171 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
B4E171 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
B4E171 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms