Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRRM5B3KS81 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM5B3KS81 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRRM5B3KS81 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRM5B3KS81 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRRM5B3KS81 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRM5B3KS81 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM5B3KS81 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM5B3KS81 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM5B3KS81 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM5B3KS81 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM5B3KS81 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM5B3KS81 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM5B3KS81 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRRM5B3KS81 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM5B3KS81 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM5B3KS81 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM5B3KS81 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM5B3KS81 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM5B3KS81 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM5B3KS81 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM5B3KS81 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM5B3KS81 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM5B3KS81 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM5B3KS81 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM5B3KS81 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM5B3KS81 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM5B3KS81 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRM5B3KS81 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRM5B3KS81 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRM5B3KS81 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM5B3KS81 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM5B3KS81 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM5B3KS81 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM5B3KS81 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM5B3KS81 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRRM5B3KS81 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRM5B3KS81 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM5B3KS81 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRM5B3KS81 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRM5B3KS81 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms