Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ3A6PVS8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ3A6PVS8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRIQ3A6PVS8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRIQ3A6PVS8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ3A6PVS8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ3A6PVS8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRIQ3A6PVS8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRIQ3A6PVS8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ3A6PVS8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ3A6PVS8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ3A6PVS8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ3A6PVS8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ3A6PVS8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRIQ3A6PVS8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRIQ3A6PVS8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ3A6PVS8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ3A6PVS8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRIQ3A6PVS8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRIQ3A6PVS8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRIQ3A6PVS8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ3A6PVS8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ3A6PVS8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ3A6PVS8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRIQ3A6PVS8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRIQ3A6PVS8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ3A6PVS8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRIQ3A6PVS8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRIQ3A6PVS8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRIQ3A6PVS8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRIQ3A6PVS8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRIQ3A6PVS8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRIQ3A6PVS8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRIQ3A6PVS8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRIQ3A6PVS8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRIQ3A6PVS8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ3A6PVS8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ3A6PVS8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ3A6PVS8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ3A6PVS8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ3A6PVS8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRIQ3A6PVS8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRIQ3A6PVS8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ3A6PVS8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ3A6PVS8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ3A6PVS8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ3A6PVS8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ3A6PVS8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ3A6PVS8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ3A6PVS8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ3A6PVS8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ3A6PVS8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ3A6PVS8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ3A6PVS8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LRRIQ3A6PVS8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ3A6PVS8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRIQ3A6PVS8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRIQ3A6PVS8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ3A6PVS8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ3A6PVS8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRIQ3A6PVS8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ3A6PVS8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ3A6PVS8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRIQ3A6PVS8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRIQ3A6PVS8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRIQ3A6PVS8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRIQ3A6PVS8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms