Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC154A6NI56 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC154A6NI56 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC154A6NI56 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC154A6NI56 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC154A6NI56 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC154A6NI56 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC154A6NI56 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC154A6NI56 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC154A6NI56 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC154A6NI56 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC154A6NI56 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC154A6NI56 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC154A6NI56 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC154A6NI56 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC154A6NI56 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC154A6NI56 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC154A6NI56 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC154A6NI56 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC154A6NI56 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC154A6NI56 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC154A6NI56 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC154A6NI56 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC154A6NI56 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC154A6NI56 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC154A6NI56 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC154A6NI56 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC154A6NI56 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC154A6NI56 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC154A6NI56 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC154A6NI56 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC154A6NI56 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC154A6NI56 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC154A6NI56 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC154A6NI56 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC154A6NI56 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC154A6NI56 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC154A6NI56 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC154A6NI56 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC154A6NI56 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC154A6NI56 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC154A6NI56 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC154A6NI56 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC154A6NI56 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC154A6NI56 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC154A6NI56 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC154A6NI56 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC154A6NI56 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC154A6NI56 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC154A6NI56 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC154A6NI56 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC154A6NI56 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC154A6NI56 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC154A6NI56 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC154A6NI56 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC154A6NI56 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC154A6NI56 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC154A6NI56 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms