Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HELTA6NFD8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HELTA6NFD8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HELTA6NFD8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HELTA6NFD8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HELTA6NFD8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HELTA6NFD8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HELTA6NFD8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HELTA6NFD8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HELTA6NFD8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HELTA6NFD8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HELTA6NFD8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HELTA6NFD8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HELTA6NFD8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms