Protein–RNA interactions for Protein: A6NFC5

TMEM235, Transmembrane protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM235A6NFC5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM235A6NFC5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM235A6NFC5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM235A6NFC5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM235A6NFC5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM235A6NFC5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM235A6NFC5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM235A6NFC5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM235A6NFC5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM235A6NFC5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM235A6NFC5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM235A6NFC5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM235A6NFC5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM235A6NFC5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM235A6NFC5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM235A6NFC5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM235A6NFC5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM235A6NFC5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM235A6NFC5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM235A6NFC5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM235A6NFC5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM235A6NFC5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM235A6NFC5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM235A6NFC5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM235A6NFC5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM235A6NFC5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms