Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA6BA6NDN3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA6BA6NDN3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA6BA6NDN3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6BA6NDN3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6BA6NDN3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6BA6NDN3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA6BA6NDN3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLGA6BA6NDN3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6BA6NDN3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6BA6NDN3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6BA6NDN3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6BA6NDN3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6BA6NDN3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GOLGA6BA6NDN3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GOLGA6BA6NDN3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GOLGA6BA6NDN3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA6BA6NDN3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA6BA6NDN3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA6BA6NDN3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6BA6NDN3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA6BA6NDN3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA6BA6NDN3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA6BA6NDN3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6BA6NDN3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6BA6NDN3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6BA6NDN3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6BA6NDN3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6BA6NDN3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA6BA6NDN3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6BA6NDN3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6BA6NDN3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6BA6NDN3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6BA6NDN3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6BA6NDN3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6BA6NDN3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6BA6NDN3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA6BA6NDN3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6BA6NDN3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6BA6NDN3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6BA6NDN3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA6BA6NDN3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6BA6NDN3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6BA6NDN3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA6BA6NDN3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA6BA6NDN3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6BA6NDN3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6BA6NDN3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6BA6NDN3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6BA6NDN3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6BA6NDN3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6BA6NDN3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6BA6NDN3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA6BA6NDN3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6BA6NDN3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6BA6NDN3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6BA6NDN3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6BA6NDN3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms