Protein–RNA interactions for Protein: A6BM72

MEGF11, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF11A6BM72 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEGF11A6BM72 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEGF11A6BM72 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEGF11A6BM72 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEGF11A6BM72 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MEGF11A6BM72 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEGF11A6BM72 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEGF11A6BM72 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEGF11A6BM72 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEGF11A6BM72 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEGF11A6BM72 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEGF11A6BM72 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEGF11A6BM72 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEGF11A6BM72 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEGF11A6BM72 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEGF11A6BM72 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEGF11A6BM72 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEGF11A6BM72 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEGF11A6BM72 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEGF11A6BM72 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEGF11A6BM72 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEGF11A6BM72 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEGF11A6BM72 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MEGF11A6BM72 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MEGF11A6BM72 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MEGF11A6BM72 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEGF11A6BM72 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEGF11A6BM72 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEGF11A6BM72 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEGF11A6BM72 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEGF11A6BM72 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEGF11A6BM72 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEGF11A6BM72 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEGF11A6BM72 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEGF11A6BM72 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEGF11A6BM72 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEGF11A6BM72 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEGF11A6BM72 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms