Protein–RNA interactions for Protein: A4QPH2

PI4KAP2, Putative phosphatidylinositol 4-kinase alpha-like protein P2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP2A4QPH2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PI4KAP2A4QPH2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PI4KAP2A4QPH2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PI4KAP2A4QPH2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PI4KAP2A4QPH2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PI4KAP2A4QPH2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PI4KAP2A4QPH2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PI4KAP2A4QPH2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PI4KAP2A4QPH2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PI4KAP2A4QPH2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PI4KAP2A4QPH2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PI4KAP2A4QPH2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PI4KAP2A4QPH2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PI4KAP2A4QPH2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PI4KAP2A4QPH2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PI4KAP2A4QPH2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PI4KAP2A4QPH2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PI4KAP2A4QPH2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PI4KAP2A4QPH2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PI4KAP2A4QPH2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PI4KAP2A4QPH2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PI4KAP2A4QPH2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PI4KAP2A4QPH2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PI4KAP2A4QPH2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PI4KAP2A4QPH2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PI4KAP2A4QPH2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PI4KAP2A4QPH2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PI4KAP2A4QPH2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PI4KAP2A4QPH2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PI4KAP2A4QPH2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PI4KAP2A4QPH2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PI4KAP2A4QPH2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PI4KAP2A4QPH2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PI4KAP2A4QPH2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PI4KAP2A4QPH2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PI4KAP2A4QPH2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PI4KAP2A4QPH2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PI4KAP2A4QPH2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PI4KAP2A4QPH2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PI4KAP2A4QPH2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PI4KAP2A4QPH2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PI4KAP2A4QPH2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PI4KAP2A4QPH2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PI4KAP2A4QPH2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PI4KAP2A4QPH2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PI4KAP2A4QPH2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PI4KAP2A4QPH2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PI4KAP2A4QPH2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PI4KAP2A4QPH2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PI4KAP2A4QPH2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PI4KAP2A4QPH2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PI4KAP2A4QPH2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PI4KAP2A4QPH2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PI4KAP2A4QPH2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PI4KAP2A4QPH2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PI4KAP2A4QPH2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PI4KAP2A4QPH2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PI4KAP2A4QPH2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PI4KAP2A4QPH2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PI4KAP2A4QPH2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PI4KAP2A4QPH2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PI4KAP2A4QPH2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PI4KAP2A4QPH2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PI4KAP2A4QPH2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PI4KAP2A4QPH2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PI4KAP2A4QPH2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PI4KAP2A4QPH2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PI4KAP2A4QPH2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PI4KAP2A4QPH2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PI4KAP2A4QPH2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PI4KAP2A4QPH2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PI4KAP2A4QPH2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PI4KAP2A4QPH2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PI4KAP2A4QPH2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PI4KAP2A4QPH2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PI4KAP2A4QPH2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PI4KAP2A4QPH2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PI4KAP2A4QPH2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PI4KAP2A4QPH2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PI4KAP2A4QPH2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PI4KAP2A4QPH2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PI4KAP2A4QPH2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PI4KAP2A4QPH2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PI4KAP2A4QPH2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PI4KAP2A4QPH2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PI4KAP2A4QPH2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms