Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBASA2RRP1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBASA2RRP1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBASA2RRP1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBASA2RRP1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBASA2RRP1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBASA2RRP1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBASA2RRP1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBASA2RRP1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBASA2RRP1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NBASA2RRP1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NBASA2RRP1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBASA2RRP1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBASA2RRP1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBASA2RRP1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBASA2RRP1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBASA2RRP1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBASA2RRP1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NBASA2RRP1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBASA2RRP1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBASA2RRP1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBASA2RRP1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBASA2RRP1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBASA2RRP1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBASA2RRP1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBASA2RRP1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBASA2RRP1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBASA2RRP1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBASA2RRP1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBASA2RRP1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBASA2RRP1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBASA2RRP1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBASA2RRP1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBASA2RRP1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBASA2RRP1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBASA2RRP1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBASA2RRP1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBASA2RRP1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBASA2RRP1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBASA2RRP1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBASA2RRP1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NBASA2RRP1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBASA2RRP1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBASA2RRP1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBASA2RRP1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBASA2RRP1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBASA2RRP1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBASA2RRP1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBASA2RRP1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NBASA2RRP1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms