Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3PXD2BA1X283 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SH3PXD2BA1X283 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SH3PXD2BA1X283 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3PXD2BA1X283 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3PXD2BA1X283 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3PXD2BA1X283 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3PXD2BA1X283 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3PXD2BA1X283 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3PXD2BA1X283 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3PXD2BA1X283 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3PXD2BA1X283 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3PXD2BA1X283 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3PXD2BA1X283 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3PXD2BA1X283 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3PXD2BA1X283 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3PXD2BA1X283 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3PXD2BA1X283 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3PXD2BA1X283 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3PXD2BA1X283 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3PXD2BA1X283 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3PXD2BA1X283 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3PXD2BA1X283 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3PXD2BA1X283 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3PXD2BA1X283 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SH3PXD2BA1X283 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3PXD2BA1X283 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3PXD2BA1X283 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3PXD2BA1X283 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3PXD2BA1X283 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3PXD2BA1X283 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3PXD2BA1X283 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3PXD2BA1X283 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3PXD2BA1X283 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3PXD2BA1X283 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3PXD2BA1X283 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3PXD2BA1X283 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3PXD2BA1X283 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3PXD2BA1X283 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3PXD2BA1X283 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3PXD2BA1X283 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3PXD2BA1X283 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3PXD2BA1X283 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3PXD2BA1X283 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3PXD2BA1X283 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3PXD2BA1X283 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3PXD2BA1X283 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3PXD2BA1X283 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3PXD2BA1X283 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3PXD2BA1X283 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3PXD2BA1X283 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms