Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPK0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPK0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1W2PPK0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1W2PPK0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1W2PPK0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A1W2PPK0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A1W2PPK0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A1W2PPK0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A1W2PPK0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A1W2PPK0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A1W2PPK0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A1W2PPK0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A1W2PPK0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A1W2PPK0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A1W2PPK0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A1W2PPK0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A1W2PPK0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A1W2PPK0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A1W2PPK0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A1W2PPK0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A1W2PPK0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A1W2PPK0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A1W2PPK0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A1W2PPK0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A1W2PPK0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A1W2PPK0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A1W2PPK0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1W2PPK0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PPK0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PPK0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPK0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PPK0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms