Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms