Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX35

IGHV3-64D, Immunoglobulin heavy variable 3-64D, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-64DA0A0J9YX35 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGHV3-64DA0A0J9YX35 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-64DA0A0J9YX35 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-64DA0A0J9YX35 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-64DA0A0J9YX35 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-64DA0A0J9YX35 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms