Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2D9

IGKV1D-13, Immunoglobulin kappa variable 1D-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms