Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYH2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0A6YYH2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0A6YYH2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0A6YYH2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0A6YYH2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0A6YYH2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0A6YYH2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0A6YYH2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0A6YYH2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0A6YYH2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0A6YYH2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0A6YYH2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0A6YYH2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0A6YYH2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0A6YYH2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0A6YYH2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0A6YYH2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0A6YYH2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0A6YYH2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0A6YYH2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0A6YYH2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0A6YYH2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0A6YYH2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0A6YYH2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0A6YYH2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0A6YYH2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0A6YYH2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0A6YYH2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0A6YYH2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0A6YYH2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0A6YYH2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0A6YYH2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0A6YYH2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0A6YYH2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0A6YYH2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0A6YYH2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0A6YYH2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0A6YYH2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0A6YYH2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0A6YYH2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0A6YYH2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0A6YYH2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0A6YYH2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0A6YYH2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0A6YYH2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0A6YYH2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0A6YYH2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0A6YYH2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0A6YYH2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0A6YYH2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0A6YYH2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0A6YYH2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0A6YYH2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0A6YYH2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0A6YYH2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0A6YYH2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0A6YYH2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0A6YYH2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms