Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1420.6 ms