Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS3Q9UPU3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms