Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCP2D1Q9UJQ7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms