Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms