Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUFT1Q9NNX1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUFT1Q9NNX1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms