Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FERMT1Q9BQL6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FERMT1Q9BQL6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms