Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC11Q96DB2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC11Q96DB2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms