Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYSND1Q2T9J0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms