Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSRP2Q16527 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSRP2Q16527 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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