Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EBI3Q14213 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms