Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIRBPQ14011 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIRBPQ14011 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIRBPQ14011 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIRBPQ14011 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIRBPQ14011 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CIRBPQ14011 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIRBPQ14011 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBPQ14011 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBPQ14011 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBPQ14011 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBPQ14011 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBPQ14011 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBPQ14011 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBPQ14011 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBPQ14011 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBPQ14011 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBPQ14011 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CIRBPQ14011 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBPQ14011 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBPQ14011 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBPQ14011 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIRBPQ14011 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIRBPQ14011 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIRBPQ14011 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIRBPQ14011 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CIRBPQ14011 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIRBPQ14011 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CIRBPQ14011 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CIRBPQ14011 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CIRBPQ14011 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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