Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF4Q08170 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms