Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3EP60228 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms