Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB4P54760 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB4P54760 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms