Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGB4P16144 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms