Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VIL1P09327 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VIL1P09327 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VIL1P09327 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VIL1P09327 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VIL1P09327 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VIL1P09327 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VIL1P09327 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VIL1P09327 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VIL1P09327 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VIL1P09327 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VIL1P09327 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VIL1P09327 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VIL1P09327 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VIL1P09327 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VIL1P09327 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VIL1P09327 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VIL1P09327 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VIL1P09327 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VIL1P09327 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VIL1P09327 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VIL1P09327 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VIL1P09327 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VIL1P09327 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VIL1P09327 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VIL1P09327 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VIL1P09327 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VIL1P09327 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VIL1P09327 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VIL1P09327 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VIL1P09327 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VIL1P09327 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIL1P09327 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VIL1P09327 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VIL1P09327 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VIL1P09327 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VIL1P09327 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VIL1P09327 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VIL1P09327 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VIL1P09327 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VIL1P09327 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VIL1P09327 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VIL1P09327 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIL1P09327 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VIL1P09327 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VIL1P09327 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VIL1P09327 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VIL1P09327 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VIL1P09327 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VIL1P09327 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VIL1P09327 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIL1P09327 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms