Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC3P02656 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC3P02656 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC3P02656 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC3P02656 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC3P02656 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOC3P02656 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOC3P02656 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC3P02656 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC3P02656 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC3P02656 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC3P02656 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC3P02656 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms