Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CALUO43852 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALUO43852 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALUO43852 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALUO43852 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALUO43852 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALUO43852 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALUO43852 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALUO43852 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALUO43852 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALUO43852 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CALUO43852 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALUO43852 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALUO43852 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALUO43852 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALUO43852 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALUO43852 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALUO43852 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALUO43852 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALUO43852 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CALUO43852 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALUO43852 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALUO43852 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALUO43852 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALUO43852 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALUO43852 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALUO43852 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALUO43852 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CALUO43852 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALUO43852 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALUO43852 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALUO43852 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALUO43852 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALUO43852 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALUO43852 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALUO43852 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALUO43852 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALUO43852 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALUO43852 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALUO43852 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALUO43852 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALUO43852 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALUO43852 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALUO43852 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALUO43852 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALUO43852 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALUO43852 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALUO43852 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALUO43852 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALUO43852 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALUO43852 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALUO43852 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALUO43852 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALUO43852 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CALUO43852 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms