Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CDKL1-203ENST00000395834 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NCOA4-203ENST00000580070 1755 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 C22orf23-206ENST00000619227 1777 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ENPP2-203ENST00000427067 3271 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ELMOD3-205ENST00000409344 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AL358075.4-201ENST00000540385 1553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PARPBP-210ENST00000541394 2452 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SLC43A3-202ENST00000395123 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RMI2-202ENST00000572173 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 DPP3-205ENST00000530165 2251 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC079880.1-201ENST00000603040 2046 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PIK3AP1-202ENST00000371109 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 FCGR1A-201ENST00000369168 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 FOSB-202ENST00000417353 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ZIK1-207ENST00000599456 2860 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 TCTE1-201ENST00000371504 616 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC026461.4-201ENST00000379816 242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SH3YL1-204ENST00000403658 1279 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RN7SKP297-201ENST00000411270 282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ACTG1P10-201ENST00000428275 1082 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 MAX-216ENST00000556979 615 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 IPO7-208ENST00000630083 195 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NTM-203ENST00000374791 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 BTBD10-201ENST00000278174 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NEFM-204ENST00000518131 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NBPF1-204ENST00000432949 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SORBS2-203ENST00000319471 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RNF170-203ENST00000319104 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NDRG4-254ENST00000569923 1312 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 APTX-215ENST00000468275 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CEP57-210ENST00000538658 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 OS9-202ENST00000315970 2691 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 HLA-DQA2-210ENST00000374940 1524 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PIPSL-202ENST00000489875 2733 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SCAMP1-207ENST00000621999 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 HSPA8-201ENST00000227378 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 DMKN-202ENST00000392206 458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SEPT4-204ENST00000412945 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ZNF805-202ENST00000414468 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC211485.1-201ENST00000417100 1107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 GNGT2-202ENST00000503070 522 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CCNB3P1-201ENST00000504855 1431 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC136475.6-201ENST00000533113 289 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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