Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.9 ms