Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PUF60Q9UHX1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PUF60Q9UHX1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms