Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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