Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZE8

MRPL35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL35Q9NZE8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
MRPL35Q9NZE8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL35Q9NZE8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms