Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP4Q9H6H4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms