Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX4Q9BYU1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.5 ms