Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP7Q93009 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP7Q93009 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP7Q93009 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP7Q93009 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP7Q93009 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP7Q93009 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP7Q93009 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP7Q93009 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP7Q93009 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP7Q93009 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP7Q93009 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP7Q93009 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP7Q93009 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP7Q93009 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP7Q93009 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP7Q93009 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP7Q93009 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP7Q93009 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP7Q93009 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP7Q93009 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP7Q93009 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP7Q93009 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP7Q93009 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP7Q93009 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP7Q93009 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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USP7Q93009 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP7Q93009 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP7Q93009 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP7Q93009 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP7Q93009 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP7Q93009 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP7Q93009 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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