Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MRPL54Q6P161 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL54Q6P161 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL54Q6P161 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms