Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DIPQ5VU43 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms